阜外医院现已拥有1个国家重点实验室,3个部级重点实验室,搭建了医院—网络医院—社区心血管病防治平台、心血管临床数据防治与分析信息化平台,心血管生物资源共享平台、中国心血管疾病医疗诊断中心等高水平的医学研究平台及全新机制的中心实验室,以开放性平台服务全国。